Minha resposta não será exatamente sobre a diferença destes motores em específico, mas...
Basicamente diferentes modelos de motores de mesma cubicagem se refletem em diferenças de velocidade, torque e consumo de combustível. Essas variáveis são muito importantes em campeonatos e corridas longas.
Normalmente, se um motor tem mais velocidade (maior RPM) ele possuirá um menor torque e seria melhor utilizado em pistas com retas longas e curvas abertas.
Já o contrário, um motor de maior torque seria melhor em pistas fechadas, onde a aceleração é mais importante que a velocidade final.
Dito isso, é uma questão do motor que melhor se adaptar à sua pista e sua forma de condução.
Diferença entre janelas e pipa irá impactar justamente nestes 3 itens, e recomendo dar uma pesquisada nos tópicos das diferenças entre
número de janelas e
afinação de pipa, principalmente nas explicações do Salvadori e do Gligoco..
Normalmente, o que se faz é conversar com o pessoal mais antigo daquela pista para ver o equipamento utilizado por eles. Afinal, é bem mais fácil obter informações de quem já testou diversos setups diferentes..
PS: Aqui temos o artigo técnico do fórum sobre Curvas e Pipas:
http://www.rcmasters.com.br/viewtopic.php?f=82&t=57240